Video ca nhạc cho "Head Above Water" được đạo diễn bởi Elliott Lester, và được ghi hình từ ngày 22 đến 23 tháng 8 năm 2018.[11] Được ghi hình tại Vík í Mýrdal ở Iceland,[12] video ca nhạc được phát hành vào ngày 27 tháng 9 năm 2018 để trùng với sinh nhật lần thứ 34 của Lavigne.[13] Nó được kết thúc với phần thông điệp liên quan đến tổ chức mang chính tên của nữ ca sĩ, được tạo ra nhằm hỗ trợ phòng ngừa, điều trị và nghiên cứu bệnh Lyme.